Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
I (XULDUD01)
89 I (XULDUD01)
(Previous) XII Acrolein
(Back) Elements:
O 1
C 6
H 6
(Z = 8)
(Periodic Table)
(Next) Dodecanoic acid (LAURAC05)
This is one of the solids used in the blind tests of crystal structure prediction.
See: "Significant progress in predicting the crystal structures of small organic molecules - a report on the fourth blind test", Acta Crys. B 865, 107-125 (2009), and
"Towards crystal structure prediction of complex organic compounds - a report on the fifth blind test", Bardwell, et. al Acta Cryst. (2011). B67, 535-551
The complete set consists of 22 solids.
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 9.68 9.85 4.95 90.00 90.57 90.00 472.06 1.324 45.9 calc'd using PM7
PM7: 9.60 9.75 4.84 90.79 90.25 91.44 453.38 1.379 19.7 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 9.72 9.82 5.01 88.42 91.20 89.91 477.37 1.309 14.3 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 25 2021 @ 21:58:12 |
Feb 23 2021 @ 22:11:51
ARC file |
Feb 25 2021 @ 04:39:49 |
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,2) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
I (XULDUD01)
O 0.02481159 +1 0.0043370 +1 -0.0109987 +1
C -1.01558132 +1 1.7079111 +1 0.9825622 +1
C -1.90966388 +1 2.5194309 +1 1.8639081 +1
C -2.46616805 +1 1.1391481 +1 2.4603146 +1
C -1.52746248 +1 0.4333187 +1 1.5340426 +1
C -0.87231418 +1 -0.5585868 +1 0.9048567 +1
H 0.56824176 +1 1.8953020 +1 -0.6121731 +1
H -1.40136230 +1 3.1455583 +1 2.6047907 +1
H -2.66659745 +1 3.1185433 +1 1.3472788 +1
H -2.26875372 +1 1.0029304 +1 3.5294855 +1
H -3.53251263 +1 0.9731100 +1 2.2728538 +1
H -0.84604471 +1 -1.6228784 +1 0.9041266 +1
C -0.08756877 +1 1.3955754 +1 0.0600009 +1
C -0.03624649 +1 -0.0442402 +1 -4.7727693 +1
C -0.96856503 +1 -0.3574437 +1 -3.8543073 +1
C -1.86415903 +1 -1.1681636 +1 -2.9723702 +1
C -2.42260725 +1 0.2125941 +1 -2.3811752 +1
C -1.48257209 +1 0.9177208 +1 -3.3069497 +1
C -0.82434688 +1 1.9103060 +1 -3.9331963 +1
O 0.07769935 +1 1.3466773 +1 -4.8436950 +1
H 0.62007830 +1 -0.5423753 +1 -5.4448988 +1
H -1.35883508 +1 -1.7923123 +1 -2.2276955 +1
H -2.62005411 +1 -1.7717042 +1 -3.4855446 +1
H -2.22520994 +1 0.3477329 +1 -1.3120474 +1
H -3.48900780 +1 0.3774075 +1 -2.5682595 +1
H -0.79916906 +1 2.9751695 +1 -3.9358711 +1
C 0.28056029 +1 -4.9777316 +1 -0.0679156 +1
C 1.20939634 +1 -5.2883302 +1 -0.9900275 +1
C 2.10405497 +1 -6.0985715 +1 -1.8725631 +1
C 2.66293495 +1 -4.7168084 +1 -2.4628514 +1
C 1.71812123 +1 -4.0123913 +1 -1.5420205 +1
C 1.05819707 +1 -3.0211281 +1 -0.9167401 +1
O 0.16349703 +1 -3.5864186 +1 0.0010896 +1
H -0.37425255 +1 -5.4799641 +1 0.6044510 +1
H 1.59392707 +1 -6.7196660 +1 -2.6164804 +1
H 2.85933029 +1 -6.7030531 +1 -1.3604857 +1
H 2.47058100 +1 -4.5784510 +1 -3.5318234 +1
H 3.72741239 +1 -4.5492026 +1 -2.2678363 +1
H 1.02663076 +1 -1.9570752 +1 -0.9212916 +1
C 0.23148023 +1 -3.5310784 +1 4.7671959 +1
C 1.16303182 +1 -3.2178286 +1 3.8479618 +1
C 2.05791168 +1 -2.4063579 +1 2.9649980 +1
C 2.61928339 +1 -3.7882091 +1 2.3781575 +1
C 1.67441758 +1 -4.4933971 +1 3.2989682 +1
C 1.01423406 +1 -5.4865603 +1 3.9218785 +1
O 0.11426882 +1 -4.9222764 +1 4.8349214 +1
H -0.42465082 +1 -3.0318422 +1 5.4393140 +1
H 1.55044444 +1 -1.7868376 +1 2.2177781 +1
H 2.81250100 +1 -1.7982897 +1 3.4742598 +1
H 2.42559296 +1 -3.9249721 +1 1.3094056 +1
H 3.68427950 +1 -3.9530352 +1 2.5719898 +1
H 0.98631265 +1 -6.5511250 +1 3.9196953 +1
O 4.94860611 +1 0.0159689 +1 -0.0176076 +1
C 3.90220437 +1 1.7158764 +1 0.9766500 +1
C 3.01235218 +1 2.5237138 +1 1.8665269 +1
C 2.45562424 +1 1.1406677 +1 2.4570459 +1
C 3.39660133 +1 0.4391310 +1 1.5294594 +1
C 4.05717747 +1 -0.5505393 +1 0.9021779 +1
H 5.48501559 +1 1.9085104 +1 -0.6205907 +1
H 3.52455459 +1 3.1443375 +1 2.6098868 +1
H 2.25585675 +1 3.1278669 +1 1.3566512 +1
H 2.65028361 +1 1.0018664 +1 3.5264909 +1
H 1.39049144 +1 0.9739438 +1 2.2626449 +1
H 4.09270529 +1 -1.6143709 +1 0.9085167 +1
C 4.82954822 +1 1.4070812 +1 0.0520267 +1
C 4.87969325 +1 -0.0456586 +1 -4.7819293 +1
C 3.94888707 +1 -0.3567723 +1 -3.8613055 +1
C 3.05890596 +1 -1.1658489 +1 -2.9710934 +1
C 2.49986905 +1 0.2174365 +1 -2.3847609 +1
C 3.44024578 +1 0.9200535 +1 -3.3122578 +1
C 4.10160240 +1 1.9112276 +1 -3.9371157 +1
O 4.99857617 +1 1.3453878 +1 -4.8516544 +1
H 5.53599961 +1 -0.5455971 +1 -5.4537379 +1
H 3.56727046 +1 -1.7849440 +1 -2.2237952 +1
H 2.30287617 +1 -1.7740169 +1 -3.4771443 +1
H 2.69424703 +1 0.3549484 +1 -1.3154413 +1
H 1.43453567 +1 0.3815058 +1 -2.5775925 +1
H 4.13418196 +1 2.9760219 +1 -3.9334424 +1
C 5.22447222 +1 -4.9735517 +1 -0.0640853 +1
C 6.15072225 +1 -5.2846579 +1 -0.9888784 +1
C 7.04379533 +1 -6.0956807 +1 -1.8717442 +1
C 7.59642709 +1 -4.7142530 +1 -2.4693143 +1
C 6.65708821 +1 -4.0090089 +1 -1.5430535 +1
C 6.00134912 +1 -3.0177007 +1 -0.9127532 +1
O 5.10850494 +1 -3.5823227 +1 0.0065063 +1
H 4.57105332 +1 -5.4750507 +1 0.6093304 +1
H 6.53789559 +1 -6.7237905 +1 -2.6122637 +1
H 7.80216021 +1 -6.6951669 +1 -1.3574917 +1
H 7.40159050 +1 -4.5792883 +1 -3.5388396 +1
H 8.66243626 +1 -4.5465255 +1 -2.2816386 +1
H 5.97460416 +1 -1.9532037 +1 -0.9126998 +1
C 5.17334239 +1 -3.5259339 +1 4.7686080 +1
C 6.10211173 +1 -3.2137926 +1 3.8460945 +1
C 6.99686154 +1 -2.4037235 +1 2.9624304 +1
C 7.55217922 +1 -3.7860201 +1 2.3710204 +1
C 6.61227927 +1 -4.4900971 +1 3.2979142 +1
C 5.95542817 +1 -5.4819052 +1 3.9269874 +1
O 5.05689288 +1 -4.9167869 +1 4.8400615 +1
H 4.51975487 +1 -3.0263372 +1 5.4424814 +1
H 6.49269993 +1 -1.7783053 +1 2.2180177 +1
H 7.75432656 +1 -1.8000968 +1 3.4741800 +1
H 7.35637393 +1 -3.9204243 +1 1.3015015 +1
H 8.61860130 +1 -3.9517297 +1 2.5585570 +1
H 5.93126115 +1 -6.5468546 +1 3.9308203 +1
Tv -0.07449320 +1 -0.1413286 +1 9.6009663 +1
Tv -0.09977679 +1 9.7487463 +1 -0.1031674 +1
Tv 9.68947286 +1 -0.0347210 +1 0.0318430 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(1,1,2) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
I (XULDUD01) (PM6-D3H4)
h= hr=NIST
O 0.02603209 +1 -0.0427642 +1 -0.0049826 +1
C -1.02488877 +1 1.6752781 +1 0.9852296 +1
C -1.92797088 +1 2.4845418 +1 1.8681817 +1
C -2.47910918 +1 1.1248502 +1 2.4659617 +1
C -1.53799285 +1 0.4053196 +1 1.5415868 +1
C -0.89038733 +1 -0.6043719 +1 0.9289583 +1
H 0.57266717 +1 1.8660766 +1 -0.6099694 +1
H -1.39507003 +1 3.1088432 +1 2.6136640 +1
H -2.69086382 +1 3.0767249 +1 1.3242534 +1
H -2.24829466 +1 0.9909324 +1 3.5408305 +1
H -3.55024194 +1 0.9458911 +1 2.2553990 +1
H -0.86348445 +1 -1.6748441 +1 0.9282744 +1
C -0.08939904 +1 1.3716641 +1 0.0634219 +1
C -0.04541109 +1 -0.0566520 +1 -4.7788806 +1
C -0.98513406 +1 -0.3554310 +1 -3.8607219 +1
C -1.89196557 +1 -1.1631958 +1 -2.9782957 +1
C -2.43794302 +1 0.2046254 +1 -2.3856619 +1
C -1.49270818 +1 0.9183887 +1 -3.3092467 +1
C -0.83757817 +1 1.9255533 +1 -3.9214507 +1
O 0.07840768 +1 1.3572403 +1 -4.8502515 +1
H 0.61594746 +1 -0.5549662 +1 -5.4496548 +1
H -1.36140154 +1 -1.7846757 +1 -2.2301994 +1
H -2.65562893 +1 -1.7506592 +1 -3.5221485 +1
H -2.20915033 +1 0.3386645 +1 -1.3114698 +1
H -3.50816137 +1 0.3846091 +1 -2.5988278 +1
H -0.80618719 +1 2.9955418 +1 -3.9237333 +1
C 0.26889778 +1 -4.9354765 +1 -0.0587083 +1
C 1.20358789 +1 -5.2416728 +1 -0.9802861 +1
C 2.10460886 +1 -6.0575765 +1 -1.8615928 +1
C 2.65743033 +1 -4.6948797 +1 -2.4609228 +1
C 1.71611400 +1 -3.9727999 +1 -1.5398497 +1
C 1.06467767 +1 -2.9623254 +1 -0.9293378 +1
O 0.14968923 +1 -3.5214321 +1 0.0057159 +1
H -0.39043416 +1 -5.4285228 +1 0.6167995 +1
H 1.57042828 +1 -6.6784218 +1 -2.6075360 +1
H 2.86497643 +1 -6.6440910 +1 -1.3180461 +1
H 2.42920230 +1 -4.5619822 +1 -3.5364595 +1
H 3.72815837 +1 -4.5159200 +1 -2.2470690 +1
H 1.03652844 +1 -1.8925928 +1 -0.9319680 +1
C 0.22078191 +1 -3.5149910 +1 4.7862102 +1
C 1.16026730 +1 -3.2160963 +1 3.8672718 +1
C 2.06730502 +1 -2.4095466 +1 2.9840690 +1
C 2.61640762 +1 -3.7729653 +1 2.3905802 +1
C 1.66996295 +1 -4.4882202 +1 3.3133649 +1
C 1.01622947 +1 -5.4949816 +1 3.9245162 +1
O 0.09938937 +1 -4.9290001 +1 4.8548816 +1
H -0.44174401 +1 -3.0180526 +1 5.4580842 +1
H 1.53630123 +1 -1.7864970 +1 2.2364491 +1
H 2.82977389 +1 -1.8185139 +1 3.5286635 +1
H 2.38966192 +1 -3.9075358 +1 1.3153705 +1
H 3.68653285 +1 -3.9526249 +1 2.6061334 +1
H 0.98425463 +1 -6.5655038 +1 3.9258383 +1
O 4.98085103 +1 -0.0455882 +1 -0.0113654 +1
C 3.92753767 +1 1.6733877 +1 0.9773907 +1
C 3.02611746 +1 2.4880735 +1 1.8579619 +1
C 2.47439899 +1 1.1249402 +1 2.4571555 +1
C 3.41618531 +1 0.4034862 +1 1.5350385 +1
C 4.06598672 +1 -0.6066718 +1 0.9234981 +1
H 5.52170115 +1 1.8619049 +1 -0.6206113 +1
H 3.55917169 +1 3.1099016 +1 2.6039742 +1
H 2.26349304 +1 3.0765757 +1 1.3122939 +1
H 2.70336571 +1 0.9929927 +1 3.5324566 +1
H 1.40347995 +1 0.9467718 +1 2.2440203 +1
H 4.09478294 +1 -1.6770744 +1 0.9241943 +1
C 4.86213343 +1 1.3683267 +1 0.0550572 +1
C 4.91137125 +1 -0.0603122 +1 -4.7946061 +1
C 3.97220802 +1 -0.3593020 +1 -3.8749311 +1
C 3.06359122 +1 -1.1636076 +1 -2.9933805 +1
C 2.51738338 +1 0.1992803 +1 -2.3986309 +1
C 3.46476017 +1 0.9136552 +1 -3.3192465 +1
C 4.11954123 +1 1.9204316 +1 -3.9300773 +1
O 5.03552946 +1 1.3539649 +1 -4.8606572 +1
H 5.57209997 +1 -0.5567099 +1 -5.4672443 +1
H 3.59359099 +1 -1.7890837 +1 -2.2464242 +1
H 2.30126745 +1 -1.7542329 +1 -3.5386979 +1
H 2.74289533 +1 0.3316717 +1 -1.3229356 +1
H 1.44714042 +1 0.3805411 +1 -2.6139937 +1
H 4.15257202 +1 2.9907488 +1 -3.9314729 +1
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