Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
1-diazonia-4-azabicyclo[2.2.2]octane glutarate (UNEFIC)
227 1-diazonia-4-azabicyclo[2.2.2]octane glutarate (UNEFIC)
(Previous) 4-(Dimethylamino)pyridinium hydrogen maleate (GUKVUE)
(Back) Elements:
C 11
H 20
O 4
N 2
(Z = 4)
(Periodic Table)
(Next) 4-Hydroxybenzoic acid isonicotinamide (VAKTOR)
In this system, one end of a glutamic acid molecule is ionized, the other is not.
One end of each diazoniaazabicyclooctane is ionized the other end is not.
This tests the ability of semiempirical methods to reproduce partial ionization.
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 10.28 12.46 10.68 90.00 66.12 90.00 1250.03 1.298 -79.0 calc'd using PM7
PM7: 10.29 12.05 10.30 90.43 62.45 90.47 1132.10 1.433 -234.8 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 10.49 11.63 10.52 90.47 64.23 90.48 1155.13 1.405 -243.1 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 25 2021 @ 11:49:26 |
Feb 23 2021 @ 00:20:08
ARC file |
Feb 23 2021 @ 18:44:04 |
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
1-diazonia-4-azabicyclo[2.2.2]octane glutarate (UNEFIC)
C 0.10260716 +1 0.1202190 +1 0.0214898 +1
C -4.52819857 +1 -6.2414725 +1 2.5924768 +1
H -5.38711231 +1 -6.8063210 +1 2.1756685 +1
H -4.79234951 +1 -6.0458491 +1 3.6553394 +1
C -4.34201239 +1 -4.9249019 +1 1.8376904 +1
H -4.63308888 +1 -5.0453822 +1 0.7729520 +1
H -3.27052256 +1 -4.6279586 +1 1.8248939 +1
C -5.16928416 +1 -3.8108946 +1 2.4832601 +1
H -6.23942027 +1 -4.0998399 +1 2.5521060 +1
H -4.82637808 +1 -3.6441133 +1 3.5315203 +1
C -5.00539995 +1 -2.5301669 +1 1.7234623 +1
O -3.12237349 +1 -7.9808654 +1 3.4375502 +1
O -2.44343239 +1 -6.9495935 +1 1.6296387 +1
O -4.13895438 +1 -2.3129982 +1 0.9006878 +1
O -5.86530209 +1 -1.5526713 +1 2.0029889 +1
H -6.55842871 +1 -1.7630720 +1 2.7994968 +1
C -3.28773494 +1 -7.1027552 +1 2.5459066 +1
C 4.09702487 +1 -5.9720865 +1 -2.2722141 +1
C 2.87077927 +1 5.2095425 +1 -2.2896350 +1
H 2.00976793 +1 5.7536436 +1 -2.7296635 +1
H 2.59544357 +1 5.0416954 +1 -1.2256506 +1
C 3.07636023 +1 3.8737196 +1 -3.0045348 +1
H 2.81493285 +1 3.9680486 +1 -4.0794903 +1
H 4.14780469 +1 3.5784203 +1 -2.9850068 +1
C 2.23430006 +1 2.7748900 +1 -2.3524141 +1
H 1.16664763 +1 3.0765619 +1 -2.2887664 +1
H 2.57356933 +1 2.6157646 +1 -1.3015252 +1
C 2.38455698 +1 1.4854511 +1 -3.1011313 +1
O 4.24455459 +1 -5.0541344 +1 -1.4163229 +1
O 4.95565926 +1 -6.1555867 +1 -3.1686813 +1
O 3.27374788 +1 1.2382631 +1 -3.8900170 +1
O 1.48189081 +1 0.5391825 +1 -2.8499928 +1
H 0.77868968 +1 0.7714704 +1 -2.0662614 +1
C 1.35694656 +1 -0.7218912 +1 0.0048435 +1
H 2.19339551 +1 -0.1464923 +1 0.4517596 +1
H 1.65710779 +1 -0.9032443 +1 -1.0506498 +1
C 1.17110987 +1 -2.0482971 +1 0.7425580 +1
H 1.46752650 +1 -1.9427193 +1 1.8076095 +1
H 0.09886740 +1 -2.3426458 +1 0.7572006 +1
C 1.99431930 +1 -3.1550800 +1 0.0790972 +1
H 3.06503196 +1 -2.8678628 +1 0.0165640 +1
H 1.65087316 +1 -3.3040376 +1 -0.9713441 +1
C 1.82441569 +1 -4.4469827 +1 0.8178410 +1
O -0.05859720 +1 0.9891038 +1 -0.8801494 +1
O -0.75424357 +1 -0.0349613 +1 0.9252608 +1
O 0.94117920 +1 -4.6753632 +1 1.6198502 +1
O 2.69352788 +1 -5.4159680 +1 0.5472191 +1
H 3.39640020 +1 -5.2080147 +1 -0.2476738 +1
C -7.25622897 +1 -1.0282833 +1 4.8446468 +1
C -6.01501618 +1 -0.1680596 +1 4.8096918 +1
H -5.17317501 +1 -0.7103304 +1 5.2882481 +1
H -5.70054235 +1 -0.0186740 +1 3.7540129 +1
C -6.24714553 +1 -10.8704835 +1 5.5766420 +1
H -5.99091990 +1 -10.9407412 +1 6.6552356 +1
H -7.32225364 +1 -10.5894791 +1 5.5431178 +1
C -5.41582268 +1 -9.7726312 +1 4.9098434 +1
H -4.34842614 +1 -10.0709007 +1 4.8360832 +1
H -5.76537849 +1 -9.6198135 +1 3.8615222 +1
C -5.56514215 +1 -8.4810480 +1 5.6545348 +1
O -7.39319492 +1 -1.9455326 +1 3.9879346 +1
O -8.13247463 +1 -0.8348837 +1 5.7228028 +1
O -6.45997531 +1 -8.2269707 +1 6.4353221 +1
O -4.65252172 +1 -7.5411977 +1 5.4159860 +1
H -3.95395100 +1 -7.7717551 +1 4.6287519 +1
C -0.97541485 +1 -5.1281462 +1 -0.8494892 +1
H -0.93696377 +1 -4.8371266 +1 0.2253048 +1
H -0.14415959 +1 -5.8431650 +1 -1.0146813 +1
C -2.33839187 +1 -5.7826076 +1 -1.1848015 +1
H -2.20433926 +1 -6.8339800 +1 -1.5274993 +1
H -2.99259901 +1 -5.8248498 +1 -0.2849838 +1
C -1.84156693 +1 -2.9586878 +1 -1.4245357 +1
H -1.66500868 +1 -2.0368344 +1 -2.0169049 +1
H -1.81011850 +1 -2.6518335 +1 -0.3544870 +1
C -3.21991986 +1 -3.5793910 +1 -1.7706319 +1
H -3.89467959 +1 -3.6032240 +1 -0.8803571 +1
H -3.73854551 +1 -2.9797418 +1 -2.5458438 +1
C -0.77680263 +1 -4.3241717 +1 -3.1115367 +1
H 0.04812741 +1 -5.0472778 +1 -3.3011409 +1
H -0.57294242 +1 -3.4304407 +1 -3.7381634 +1
C -2.14011623 +1 -4.9611929 +1 -3.4881815 +1
H -2.64169035 +1 -4.3832194 +1 -4.2949933 +1
H -1.99755792 +1 -6.0065385 +1 -3.8479502 +1
N -0.74469403 +1 -3.9228901 +1 -1.6848360 +1
N -3.02403384 +1 -4.9881256 +1 -2.2674949 +1
H -4.01818377 +1 -5.4490221 +1 -2.5278990 +1
C 1.93254038 +1 4.2211025 +1 3.5658255 +1
H 1.98088804 +1 3.9330335 +1 4.6406405 +1
H 2.75157431 +1 4.9491618 +1 3.3955408 +1
C 0.55983633 +1 4.8539984 +1 3.2312032 +1
H 0.67858060 +1 5.9041672 +1 2.8799193 +1
H -0.09127782 +1 4.8962104 +1 4.1326290 +1
C 1.09796232 +1 2.0360637 +1 2.9921279 +1
H 1.28270985 +1 1.1211154 +1 2.3921253 +1
H 1.14073861 +1 1.7235797 +1 4.0596968 +1
C -0.29331052 +1 2.6354579 +1 2.6596270 +1
H -0.95719854 +1 2.6506382 +1 3.5581588 +1
H -0.81247342 +1 2.0261597 +1 1.8920434 +1
C 2.13730670 +1 3.4204523 +1 1.3052117 +1
H 2.94230889 +1 4.1662986 +1 1.1171060 +1
H 2.36881452 +1 2.5357769 +1 0.6763969 +1
C 0.75672750 +1 4.0217924 +1 0.9312198 +1
H 0.26171953 +1 3.4266959 +1 0.1344622 +1
H 0.87200721 +1 5.0670912 +1 0.5602749 +1
N 2.17917129 +1 3.0181503 +1 2.7313664 +1
N -0.12137242 +1 4.0444664 +1 2.1559965 +1
H -1.12227756 +1 4.4953032 +1 1.9021651 +1
C -2.20946732 +1 -1.8998066 +1 3.4277020 +1
H -2.26419744 +1 -2.1714570 +1 2.3481710 +1
H -3.05094267 +1 -1.2038803 +1 3.6221841 +1
C -0.85288587 +1 -1.2245099 +1 3.7488606 +1
H -1.00082664 +1 -0.1794345 +1 4.1062457 +1
H -0.21648073 +1 -1.1568897 +1 2.8380702 +1
C -1.28715010 +1 -4.0599264 +1 3.9522728 +1
H -1.43594278 +1 -4.9943527 +1 4.5333497 +1
H -1.32657074 +1 -4.3488705 +1 2.8773928 +1
C 0.08236967 +1 -3.4160561 +1 4.2924560 +1
H 0.74769762 +1 -3.3675795 +1 3.3961815 +1
H 0.62073643 +1 -4.0157213 +1 5.0538096 +1
C -2.35284323 +1 -2.7497275 +1 5.6785571 +1
H -3.19616278 +1 -2.0578641 +1 5.8981844 +1
H -2.51444469 +1 -3.6623068 +1 6.2905439 +1
C -1.00290468 +1 -2.0776918 +1 6.0422385 +1
H -0.47542329 +1 -2.6469925 +1 6.8387044 +1
H -1.16711770 +1 -1.0393828 +1 6.4120328 +1
N -2.40070302 +1 -3.1244564 +1 4.2447716 +1
N -0.13562572 +1 -2.0184901 +1 4.8108234 +1
H 0.85316576 +1 -1.5405288 +1 5.0668730 +1
C -5.11407734 +1 0.9819698 +1 -1.0772506 +1
H -5.15172176 +1 1.2745572 +1 -2.1516608 +1
H -5.96580221 +1 0.2926959 +1 -0.9087679 +1
C -3.77058908 +1 0.2870236 +1 -0.7473730 +1
H -3.93521073 +1 -0.7531645 +1 -0.3825894 +1
H -3.13002621 +1 0.2036807 +1 -1.6536818 +1
C -4.18606761 +1 3.1311632 +1 -0.5205820 +1
H -4.32614083 +1 4.0572217 +1 0.0760170 +1
H -4.22892277 +1 3.4392853 +1 -1.5896936 +1
C -2.81886803 +1 2.4737719 +1 -0.1984972 +1
H -2.16457651 +1 2.4251213 +1 -1.1027053 +1
H -2.26764574 +1 3.0639406 +1 0.5615384 +1
C -5.26156649 +1 1.8002914 +1 1.1861942 +1
H -6.09947790 +1 1.0972749 +1 1.3906297 +1
H -5.43907907 +1 2.7018636 +1 1.8107315 +1
C -3.90661572 +1 1.1360129 +1 1.5479728 +1
H -3.37820432 +1 1.7094388 +1 2.3406786 +1
H -4.06435851 +1 0.0971381 +1 1.9212236 +1
N -5.30309390 +1 2.1951984 +1 -0.2422311 +1
N -3.04299002 +1 1.0747049 +1 0.3138226 +1
H -2.05504995 +1 0.5873523 +1 0.5616045 +1
Tv -10.28531891 +1 0.0930189 +1 0.2876156 +1
Tv -0.00715681 +1 -12.0496496 +1 0.0799173 +1
Tv -4.50562695 +1 0.1413677 +1 9.2599194 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
1-diazonia-4-azabicyclo[2.2.2]octane glutarate (UNEFIC) (PM6-D3H4)
C 0.16714455 +1 0.1712948 +1 0.1579400 +1
C -4.66535747 +1 -6.1898136 +1 2.5672307 +1
H -5.52917176 +1 -6.8049093 +1 2.2157552 +1
H -4.84143976 +1 -5.9550976 +1 3.6486010 +1
C -4.57273266 +1 -4.9003244 +1 1.7550534 +1
H -4.99176129 +1 -5.0651869 +1 0.7289031 +1
H -3.49528366 +1 -4.6143463 +1 1.6350629 +1
C -5.31976572 +1 -3.7500543 +1 2.4394296 +1
H -6.41821903 +1 -3.9615568 +1 2.4598838 +1
H -4.95911005 +1 -3.6387485 +1 3.4986086 +1
C -5.01967080 +1 -2.4523634 +1 1.7515291 +1
O -3.24399269 +1 -7.9783499 +1 3.2951888 +1
O -2.53022800 +1 -6.7904041 +1 1.5910665 +1
O -4.02451333 +1 -2.2158651 +1 1.0814139 +1
O -5.90150939 +1 -1.4395291 +1 1.8965363 +1
H -6.72356671 +1 -1.6414412 +1 2.5704608 +1
C -3.40467781 +1 -7.0239293 +1 2.4659153 +1
C 4.11698899 +1 -5.5463004 +1 -2.2791157 +1
C 2.66897113 +1 5.5705073 +1 -2.4359835 +1
H 2.09410722 +1 6.3376722 +1 -3.0085339 +1
H 2.18470684 +1 5.4785867 +1 -1.4326790 +1
C 2.61860524 +1 4.2340348 +1 -3.1808420 +1
H 1.76602973 +1 4.2413645 +1 -3.9024171 +1
H 3.56954949 +1 4.0905000 +1 -3.7531949 +1
C 2.45709988 +1 3.0524383 +1 -2.2203385 +1
H 1.45435241 +1 3.1014159 +1 -1.7281827 +1
H 3.24919024 +1 3.1171919 +1 -1.4177954 +1
C 2.65182013 +1 1.7409416 +1 -2.9246940 +1
O 4.46487415 +1 -5.0057936 +1 -1.1764568 +1
O 4.93960292 +1 -5.6044129 +1 -3.2273904 +1
O 3.51750038 +1 1.4649983 +1 -3.7406237 +1
O 1.79595548 +1 0.7446962 +1 -2.5939335 +1
H 1.05857149 +1 1.0301737 +1 -1.8587175 +1
C 1.43801834 +1 -0.6503631 +1 0.0696487 +1
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